组织发展的指导思想和理论基础是系统论、情景论和行为论。

组织发展首先接受了现代系统理论的观点，把组织看成为一个开放的、有机的、复杂的社会技术系统。组织一端是原材料、资金、能源、劳动力和信息的输入；另一端是产品、劳务和利润的输出。其中间的转换过程必须经过生产、技术、人事等分系统。这些系统中任何一个子系统的改变，都会影响其他子系统甚至整个系统的变化。变革的原动力往往要追溯到人的行为和人际关系。因此，典型的组织发展计划是通过改变职工的态度、价值观和信息交流，使他们认识变革的必要性并参与和实现组织的变革。

其次，组织发展也接受了现代情景理论的观点。认为企业必须根据自身所处的内外环境，即情景的变化来确定任务。管理关系应以环境情景作为自变量，管理作为因变量，要有的放矢地使管理适应情境。管理心理学家贝尼斯认为，现代组织必须解决好以下与人的因素有关的基本问题：

（1）工作者的需要与管理目标的综合；

（2）权力分配；

（3）在企业中调解冲突；

（4）组织对变化条件的适应；

（5）组织的成长。

行为理论也是组织发展的重要理论基础。根据行为论的观点，企业中人的行为是作为组织和个人相互作用的结果，企业组织能影响和控制人们的行为，同时不同的组织结构可以产生不同的群体气氛，从而影响职工的行为和组织的经营效果。通过组织发展要有意识地改变人的行为风格、价值取向、工作的熟练程度，与此同时还要改变管理人员的认知方式，以及考察和解决组织问题的方法。