当非正式群体的组织结构与正式群体不一致或非正式群体的目标、利益与正式群体组织目标、利益发生冲突时，非正式群体将会成为正式群体的负能量，阻碍正式群体的正常运行，影响组织目标的实现，产生消极作用。主要表现在以下3个方面：

①产生抵触情绪，形成对立面。当非正式群体中的某些成员（特别是非正式群体中的核心成员）因心理需要得不到满足或与正式群体目标相背离时，由于心理调节不当、沟通低效等原因而容易产生心理矛盾、紧张和冲突，个体表现出不满甚至对抗的情绪，这种消极情绪又会很快感染其他成员，并引起其他成员的同情、默认或支持，从而导致非正式群体对正式群体产生抵触情绪甚至对立行为。

②影响工作效率。存在于正式群体中的非正式群体成员除了参与正式群体的各类活动以外，还要在业余时间频繁地参与非正式群体的各类活动，因而其成员常常在工作中精力不足、思想不集中等；存在于正式群体中的非正式群体成员间以情感为联系纽带，在工作中的相互交往容易以非正式群体规范代替正式群体规范，一旦两种规范产生冲突时，对非正式群体规范的遵从和对正式群体规范的忽视必将影响正式群体行为绩效。

③传播谣言。非正式群体的信息沟通具有以情感为基础、灵活、迅速及携带感情色彩等特点。正式群体信息传递过程中，所属非正式群体结合个人对信息内容的情感倾向以及服务于个人、非正式群体目标的实现等情况，容易夹杂个人臆想成分，甚至夸张、歪曲或隐瞒信息内容的某些特性，成为传播小道消息乃至谣言的场所，从而破坏正式群体信息有效沟通、影响正式群体协调的稳定关系，阻碍正式群体对目标的实现。

非正式群体的消极作用在一定条件下还表现在影响正式群体团结、泄露商业秘密、损害正式群体社会形象等方面。