不同类型团队的薪酬方案可能具备自己独有的特点。

在设计平行团队的薪酬方案的结构时，公司管理者需要确保成员会将小部分时间和精力投入到团队工作中，而将大部分时间和精力投入到自己的常规、全职工作中。如果公司支付的团队薪酬过高，则很容易使团队成员忽视自己的全职工作，而过分的关注团队工作。因此，平行团队通常不使用激励性薪酬形式，而认可奖励尤其是非货币性认可奖励比较适用于平行团队。

流程团队的薪酬方案结构既简单又复杂。基本工资与加薪应是流程团队薪酬方案结构的关键，对能力和技能的支付是基础。团队中的每个成员通常应该能够胜任其他成员所做的工作。为鼓励团队成员接受交叉培训，可以采用基于个人技能的加薪计划。流程团队的成员必须有同样的发展和接受奖励的机会。对于流程团队成员来说，激励效果最大的是在事前清楚的确定对绩效的奖励。因此，预先确定的激励性薪酬是薪酬方案结构中的一个重要环节。但公司管理者还需要考虑流程团队成员固定薪酬和可变薪酬的平衡问题。

基本工资和加薪在项目团队的薪酬结构中属于传统组成部分。项目团队薪酬结构中的可变性来自少量货币性奖励和基于团队绩效的激励性薪酬。少量的货币性奖励被广泛地用于事后奖励绩效。但事前的激励性薪酬在项目团队薪酬方案结构中的地位并不像在流程团队薪酬方案结构中那样重要，因为在项目团队薪酬方案结构中采用激励性薪酬有几个弊端：其一，项目团队的工作通常比流程团队的工作更难量化；其二，一些事件的发生，如竞争策略的改变、创新、新技术的引进等都可能会导致预先设定的目标作废；其三，如果项目是半途而废的，就会使方案更复杂。