行业结构学派将产业组织理论引入了企业战略管理分析，提出了企业竞争战略理论，首开了总结通用战略的先河。最重要的是，波特提出的五种竞争作用力模型、价值链分析等理论方法，为复杂而又难以捉摸的战略问题提供了一个简明而有力的分析工具。

但是，行业结构学派的理论也有着明显的缺陷。首先，行业结构学派的战略观念是静态的，没有充分考虑竞争环境的快速和动态变化对企业战略的影响。其次，过分强调市场竞争。行业结构学派的理论强调竞争是企业成败的关键，这样的零和博弈式的竞争观念已经难以适应现在的市场环境，制定企业战略需要考虑竞争对手的反应，但这并不是第一位的要素，忽视了顾客所需要的价值才是企业最大的损失和失败。最后，产业结构的分析方法尚不完善，五种竞争作用力的分析模式忽视了影响企业战略的很多重要因素，尤其是企业资源、能力等内部因素对企业战略的影响。

随着时代的发展，人们越来越认识到，企业所处的环境及其采用的战略是一个极为复杂的系统，只有从每一个相关角度深入分析，才有可能得出正确的结论。而波特把复杂的环境性因素简化为五种力量、把多样化的战略形态简化成三四种基本竞争战略的做法，容易束缚企业面向未来、发挥战略创造性的能力。同时，波特一再反对在同一业务中同时采用成本领先与差异化的“夹在中间”战略，认为成本领先与产品差异化水火不相容，但新的生产方式的出现，如戴尔（Dell）及李维斯（Levis）的大规模定制概念已经使波特的这一论断无法成立。