在绩效考核指标确定以后，接下来的工作就是明确指标之间孰重孰轻。即权重赋值。其实，考核权重的设计关系到工作行为的导向问题，对某一个指标过分看重或者过分轻视，都会带来不良后果。假设一个部门有“服务质量”和“销售额度”两个指标，究竟是赋予哪个指标较高的权重，这对员工的行为会产生很大影响。
关于权重系数的精确测度主要有“专家咨询法（Delphi）、层次分析法（Analytical Hierarchy Process，简称AHP）、二项系数加权法、环比评分法”等。其中比较有代表性的、较成功的主要有Delphi法和AHP。
指标权重分配后，在后期考核中可以不断根据考核情况进行修正，或者根据被考核者工作重心的调整而进行相应的调整。完善的考核体系应当是不断修正，不断完善，而不是一成不变的。