理解质量管理体系文件的层次应注意如下几个问题：
（1）质量管理体系文件主要由质量手册、质量管理体系程序文件和作业程序、表格、报告等质量文件构成。
（2）各层次文件可以分开，也可以合并，即其中任何层次的文件都可分开（利用相互引用的条目）也可以合并。
（3）当各层次文件分开时，有相互引用的内容，可附引用内容的条目。
（4）下一层次文件的内容不应与上一层次文件的内容相矛盾，下一层次文件应比上一层次文件更具体、更详细。
（5）也有的文献把文件中的作业程序作为第三层次，把表格、报告和记录等作为第四层次。
（6）各层次间合并还是分开，可由组织根据自己的习惯和需要去决定。