按照整个组织系统内部各支系统的职权性质和职权范围来划分，领导体制可分为层级制和职能制。

层级制，亦称层次制、直线制，是指一个组织系统从纵向的垂直线上划分为若干个层次，从指挥中心到最基层形成一个“宝塔式”的指挥系统，即层层进行直接的指挥、监督和控制。每一层级对上一级层级负责。如行政系统的国务院、省政府、县政府、乡政府之间的隶属关系，就是层级制领导体制。职能制，亦称分职制、机能制，是指一个组织系统在横向的平行线上设置若干职能部门，各部门之间的关系是法定平等的关系，但各有其独特职能和业务范围，如国务院各部（委），省、市人民政府各厅（局）等，都是按照职能制建立起来并开展工作的。

层级制的优点是：权力集中，指挥统一；分级负责，步调一致；责任明确，行动迅速；各级领导业务性质相同，调动工作时的适应能力比较强。其缺点是：容易造成领导者包揽一切，影响下属积极性的发挥；容易使领导者陷入事务堆里，导致草率行事。

职能制的优点是：分工精细，各司其职；业务熟练，效率较高；易于培养专门人才。其缺点是：专业性的业务容易产生较大的依赖性；分工精细会造成机构臃肿，部门林立，人浮于事，基层忙乱的现象；主管部门过多，形成政出多门、多头领导；容易产生层层设卡，职能交叉，手续繁多，不利于整体协调。

值得注意的是，在一般的大型组织中，特别是国家行政机关组织体系中，层级制和职能制必须紧密结合，混合使用，形成直线节制、纵横协调、互相促进的综合体制。例如，我国行政系统就是如此，国务院、省政府、县政府的权限划分体现了层级制，各级政府所属的各部委办、厅局室等则属于职能制。

在建立层级制与职能制相结合的领导体制时，应注意解决好以下问题：

一是管理幅度问题。所谓管理幅度是指一个组织所领导的组织人员的数额及其区域分布。管理幅度过小，该组织不能充分发挥效能；管理幅度过大，会造成组织领导超负荷运转。所以，管理幅度要适当，要根据组织的任务、目标、实践经验等合理地加以确定。

二是层次设置问题。纵向层次太少，会加大领导者的工作量，降低对领导者进行有效控制的能力；纵向层次太多，又会增加中间环节，延缓领导进程。一般来说，纵向层次设置的多少主要取决于管理幅度和工作量。

三是各层级的职能部门划分问题。职能部门的划分，主要取决于领导职权的性质及其分解方式。领导职权性质不同，职能部门便不同；领导职权分解不一样，职能部门也会不一样。职能部门的划分，还取决于上一级职能部门的设置状况。

四是各职能部门职责和权限的确定问题。在职能部门不变的情况下，对于新增职权，应明确授予某一部门，对于涉及几个部门的工作，应指定牵头部门，以避免扯皮拖沓。